Linha 1: Biodiversidade Aplicada ao Meio Ambiente
Processos ecológicos, estrutura e dinâmica ecológica de comunidades, ecossistema; Ecologia vegetal; Ecologia de paisagem; Diversidade filogenética; Manejo e conservação da biodiversidade; Gestão e conservação de recursos naturais; Cultura, sociedade e educação ambiental para o desenvolvimento socioambiental; Ecologia de plantas e da biota aquática para a conservação da biodiversidade; Modelagem de nicho ecológico e mudanças climáticas, Prospecção de produtos naturais, síntese orgânica e biotecnologia.
Linha 2: Indicadores de Sustentabilidade para Agroecossistemas
Desenvolvimento de tecnologias químicas; Melhoramento vegetal; Química do solo; Manejo e conservação do solo e da água; Sistemas agroflorestais biodiversos; Química dos produtos naturais; Saneamento ambiental; Exploração de recursos e degradação ambiental; Questões de sustentabilidade relacionadas a energia e a recursos naturais; Sistema agrícola integrado sustentável; Caminhos para a eco-agricultura sustentável; Desenvolvimento sustentável no Mato Grosso do Sul; Instituições, governança e políticas públicas; Educação, conscientização e ética ambiental.
