O PPGDRS estabeleceu em seus documentos normativos e no Planejamento Estratégico  os seguintes objetivos: a) Fomentar o desenvolvimento dos sistemas produtivos regionais  e, através disso, contribuir para o desenvolvimento regional, respeitando as questões socioculturais; b) realizar estudos que atendam as demandas socioeconômicas e ambientais relacionadas ao desenvolvimento dos Sistemas Produtivos Regionais e Locais; c) analisar as trajetórias de desenvolvimento regional e local;  d) analisar o processo de formação histórico, econômico e social da região e seus desdobramentos atuais.

Neste sentido, definiu-se a Missão Gerar e disseminar conhecimentos e produtos para a promoção do desenvolvimento regional e dos sistemas produtivos nos territórios e a Visão Ser reconhecido como Programa de referência em Desenvolvimento Regional e Sistemas Produtivos.