A Pró-Reitoria de Ensino, responsável pelo planejamento, coordenação, execução, controle, supervisão e avaliação das atividades de ensino de graduação da Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul, exerce suas competências através dos seguintes órgãos:
Núcleos de Ensino Núcleo de Ciências Agrárias e Engenharias – Mercia | 3902-2647 Núcleo de Ciências Biológicas e da Saúde – Alessandra | 3902-2517 Núcleo de Ciências Exatas e da Terra – Edmilson | 3902-2514 Núcleo de Ciências Sociais Aplicadas – - | 3902-2647 Núcleo de Ciências Humanas – Leandro | 3902-2514 Núcleo de Linguísticas, Letras e Artes – Carla | 3902-2513 Núcleo Intercultural – Beatriz Landa | 3902-2647