Missão: O PGBSA tem como missão formar recursos humanos qualificados com habilidade para desenvolver soluções inovadoras e obter indicadores de qualidade ambiental que servirão de base para a elaboração de políticas públicas, visando o fortalecimento de sociedades sustentáveis.

Visão: A visão do PGBSA é ser reconhecido como um Programa de excelência científica e inovação na conservação da biodiversidade e manejo de ecossistemas de transição (Cerrado e Mata Atlântica) e de áreas úmidas da Ecorregião transfronteiriça de Mata Atlântica do Alto Paraná (Brasil e Paraguai) que impulsionem a sustentabilidade regional, aliando o bem-estar social e cultural a preservação e a conservação da biodiversidade brasileira.