O PGRN está organizado em três linhas de pesquisa, sendo que a participação dos docentes permanentes não se restringe a apenas uma delas. São elas:
1 - Ambientes Naturais
Avaliar as condições ambientais (solo, água, atmosfera e biota), principalmente da biodiversidade regional, por meios dos estudos da relação com os fatores abióticos, como pesticidas, dejetos industriais, queimadas entre outros.
2 - Produtos Naturais
Pesquisar e identificar fontes naturais e interpretar como elas podem ser utilizadas na farmacologia, na indústria de alimentos, em indústrias de biodiesel entre outras, sem agressão ao meio ambiente.
3 - Materiais e Métodos Aplicados aos Recursos Naturais
Desenvolver metodologias de análises e materiais avançados (biomateriais, cerâmicas, polímeros, vidros entre outros) que possam diagnosticar e monitorar os recursos naturais.
