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O PGRN está organizado em quatro linhas de pesquisa, sendo que a participação dos docentes permanentes não se restringe a apenas uma delas. São elas:

1 - Ecologia e Conservação da Biodiversidade

Avaliar as condições ambientais (solo, água, atmosfera e biota), principalmente a relação da biodiversidade regional com os fatores abióticos, como pesticidas, resíduos industriais, queimadas, entre outros distúrbios. As sublinhas associadas são:

• Biologia e Ecologia Vegetal e Animal
• Ecologia Química e Comportamental
• Dinâmica e avaliação do risco ambiental de agroquímicos
• Avaliação, reabilitação ambiental e respostas ao estresse
• Aplicações de tecnologias, análise de dados e modelagem computacional  em processos, diagnóstico e monitoramento  de questões climáticas, ambientais, recursos naturais e saúde

2 - Bioprospecção, Biotecnologia e Desenvolvimento de Bioprodutos

Pesquisar e identificar fontes naturais e interpretar como estas podem ser utilizadas na farmacologia, na indústria de alimentos, em bioenergia, em biotecnologia entre outras, com o menor impacto possível ao meio ambiente. As sublinhas associadas são:

• Avaliação da composição química e atividades biológicas de plantas e animais
• Identificação de fontes naturais de recursos no Cerrado: Potencial de uso e aplicabilidade

3 - Tecnologias e Inovação em Recursos Naturais

Desenvolver metodologias de análises e materiais avançados (biomateriais, nanomateriais, cerâmicas, polímeros, vidros, cristais entre outros) que possam ser utilizados em processos, diagnóstico e monitoramento dos recursos naturais. As sublinhas associadas são:

• Desenvolvimento de materiais e metodologias de análise e caracterização
• Estudos de composição e estabilidade oxidativa de óleos e biodiesel
• Nanomateriais

4 - Sociedade, Cultura e Recursos Naturais

Investigar as relações entre sociedade, cultura e recursos naturais sob uma perspectiva interdisciplinar e interseccional. Envolve estudos sobre representações culturais e sustentabilidade, abordando temas como educação ambiental e percepções culturais da qualidade de vida. As sublinhas associadas são:

• Representações Culturais da Natureza, Saúde e Morte
• Educação para a Sustentabilidade
• Percepções Socioculturais e Políticas sobre Qualidade de Vida e Sustentabilidade