A Unidade Universitária de Naviraí - UEMS conta com laboratórios de Ensino (Laboratório de Química 1 e Laboratório de Química 2), e laboratórios de Pesquisa vinculados ao Centro de Desenvolvimento de Tecnologias Químicas. É importante ressaltar que os docentes do curso de Química Licenciatura e Engenharia de Alimentos são vinculados ao CDTEQ, além de serem vinculados ao Programa de Pós-graduação em Recursos Naturais (PGRN), e tem grande capacidade em captação de recursos externos (emendas parlamentares, editais CNPQ, Fundect, Finep, Termos de Ajuste de Conduta, etc) e muito da infraestrutura advém também destas ações.
Laboratório de Química 1: é equipado para práticas de Química Geral, Físico-Química, Química Analítica e Química Inorgânica, também sendo usado para projeto de extensão.
Laboratório de Química 2: está equipado para aulas práticas de Bioquímica, Química Orgânica, Química Ambiental e algumas práticas de química Inorgânica e Química Analítica.
Laboratório de Microbiologia: equipado para as aulas práticas de Microbiologia Geral, de Alimentos e Agrícola.
Laboratório de Alimentos: equipado para aulas de tecnologia de alimentos, carnes, pães, análise sensorial e controle de qualidade.
Os laboratórios didáticos contam com balanças analíticas, bombas de vácuo, câmaras de ultravioleta, capelas, estufas e centrífugas, evaporador rotativo, extrator de óleos, geladeiras e refrigeradores. Conta também com destiladores e deionizador de água, fotômetro de chama, mufla, potenciostato, espectrofotômetros na região do ultravioleta-visível, pH-metro, microscópios, centrífuga refrigerada e destilador de nitrogênio.
Liman: Laboratório Interdisciplinar de Materiais Avançados: capelas de exaustão, Forno mufla com câmara interna de 40 L e alcance até 1200 ºC; Forno mufla com câmara interna de 20 L e alcance até 1100 ºC; Mecanismo microprocessado para processo de deposição de filmes finos por dip-coating; Desumificador automatizado; Medidor de umidade; Medidor de radiação UVA-UVB; Medidor de temperatura à distância por infravermelho; pHmetro de bancada; Multímetro de bancada; Deionizadormili-Q; Banho termostatizado com circulação contínua com controle de temperaturas de 5 a 90 ºC; Placas de agitação com aquecimento; Compressor de ar com filtração e circuito interligado em todo o laboratório; Balança analítica; Estufa de secagem com circulação forçada; Multiparâmetro de condutividade, pH e sólidos em suspensão; Bomba de vácuo; Sistema Trap de segurança para vácuo; Bomba peristáltica; Lavadora ultrassônica; câmaras escuras para fotocatálise.
Lapoex: Laboratório de Pesquisa com óleos e Extratos: Balanças analíticas; Balança semi-analítica; Estufas de secagem; pHmetro; Mantas de aquecimento; Chapas de aquecimento; Agitador de tubo tipo vortex; Capelas de exaustão; Visualizador de placa cromatográfica; Evaporadores rotativos a vácuo; Bombas de vácuo; Banho refrigerado com circulação, Centrífuga refrigerada, Destilador de água de vidro, Moinho triturador, Agitadores magnéticos com aquecimento; extratores tipo Clevenger, extratores tipo Soxhlet, Cubas cromatográficas (analítica e preparativa), Colunas para cromatografia, Prensa para extração de óleo fixos, Freezer, Geladeira, Vidrarias em geral.
LabNano – Laboratório de Síntese, Caracterização e Aplicação de Nanomateriais Multifuncionais: capelas de exaustão, lavadora ultrassônica, deionizador de água, osmose reversa, chapas de agitação com controlador de temperatura microprocessadas, reator hidrotérmico convencional, estufas de secagem e bacteriológica, rede de gás com bicos de Bunsen; centrífuga com controle de temperatura, Refrigerador, forno mufla de 20 L interno com temperatura até 1100 ºC; câmaras escuras dotadas de lâmpadas UV-C e UV-A e bomba de fluxo de ar par fotocatálise; bomba peristática;
LBBTEC - Laboratório de Bioinorgânica e Biotecnologia: um almoxarifado com exaustor de ar, capelas de exaustão, chapas de aquecimento, lavadora ultrassônica, destilador de água, rotaevaporador, bomba à vácuo, banho termostatizado; vidrarias para refluxo, mantas aquecimento, chapas de agitação; estufa de secagem; potenciostato/galvanostato Autolab; potenciostato galvanostato Quimis; pHmetro; Condutivímetro; ponto de fusão; balança analítica; bomba peristáltica.
Laboratório Multiusuário de caracterização estrutural: